脑干包括中脑，脑桥及延髓。上接间脑，下续脊髓，后借小脑上、中、下脚与小脑相连接。脑干内有许多神经核和传导束，比较重要的有：

1. 神经核：脑干内有第3~12脑神经核。其中滑车神经核、展神经核、副神经核和舌下神经核都是纯运动性的；前庭蜗神经核是纯感觉性的；动眼神经核、三叉神经核、面神经核、舌咽神经核和迷走神经核都是混合性的。此外，1个脑神经核可与两对或多对脑神经发生联系，如疑核是舌咽神经和迷走神经共同的运动核，孤束核是面神经、舌回神经和迷走神经共同的也是一的内脏核。
2. 感觉传导路中转核：（1）上丘：视觉反射中枢，其上部是眼球的垂下运动中枢。（2）下丘：听觉反射中枢。（3）红核：在功能上与保持肌张力和姿势调整有关。（4）黑质、中介核、脑桥核、下橄核及网状核：都与保持肢体肌张力和姿势调整有关。
3. 上行传导束：有薄束、楔束、内侧丘系、脊髓丘系、脊髓小脑前束、脊髓小脑后束、三叉丘系、三叉神经脊系和外侧丘系。全身的感觉通过这些传导束传入大脑。
4. 下行传导束：有锥体束、皮质脑桥束、皮质脑桥束、顶盖脊髓束、顶盖脑干束、红核脊髓束、内侧纵束。大脑对四肢肌肉和面部肌肉的各种指令就是通过这些传导束来完成的。

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